Лысак Людмила Вячеславовна
-
Таксономическая структура бактериальных сообществ ризосферной почвы под растениями верховых болотВестник Московского Университета. Серия 17. Почвоведение. 2020. № 2. c.45-52подробнее1722
-
Впервые методом высокопроизводительного секвенирования гена 16S рРНК изучено соотношение крупных таксонов и родовой спектр бактерий в бактериальных сообществах ризосферной почвы под растениями верховых болот. Установлено доминирование ацидобактерий и альфа-протеобактерий при низком содержании других таксонов (< 10%). Среди обнаруженных родов бактерий преобладают представители филумов Acidobacteria и Actinobacteria, а также класса Alphaproteobacteria филума Proteobacteria. Выявлены общие роды бактерий в ризосферной почве под растениями и в поверхностных слоях верхового торфа. Представители большинства родов адаптированы к росту в кислой среде и при низких температурах, использованию сахаров, полисахаридов, ароматических соединений, органических и аминокислот. Широко представленные в бактериальных сообществах бактерии родов Cytophaga и Acidothermus способны к деструкции целлюлозы, рода Occallatibacter - хитина, рода Nocardia - гумусовых веществ и лигнина.
Ключевые слова: верховые болота; растения; ризосферная почва; бактериальные сообщества; филумы; спектр родов; функции бактерий; высокопроизводительное пиросеквенирование; метабаркодинг гена 16S рРНК
-
-
Ауксин-продуцирующая активность штаммов бактерий и дрожжевых грибов, выделенных из компонентов почвенных конструкцийВестник Московского Университета. Серия 17. Почвоведение. 2021. № 4. c.23-30подробнее1901
-
Был исследован комплекс культивируемых сапротрофных бактерий и дрожжевых грибов в компонентах почвенных конструкций различного генезиса (гумусовый почвенный горизонт и торф) одновременно с оценкой ауксин-продуцирующей активности (синтез 3-индолилуксусной кислоты, ИУК) выделенных из них штаммов бактерий и дрожжевых грибов. Исследование проводили на этапе закладки двух вариантов конструкций в г. Сыктывкар, сформированных из компонентов местного происхождения (вариант 1) и привезенных (гумусовый почвенный горизонт, Москва, торф «Селигер-агро», Тверская область) (вариант 2).
Таксономическая структура комплексов микроорганизмов, выделенных из изученных субстратов, обладала значительным сходством. В то же время в компонентах варианта 1 было выявлено большее разнообразие устойчивых к неблагоприятным условиям окружающей среды видов культивируемых сапротрофных бактерий рода Bacillus, а также присутствие психрофильных базидиомицетовых дрожжей Leucosporidium scottii, которые не были встречены в компонентах варианта 2.
Средняя продукция ИУК штаммами дрожжевых грибов исследованной выборки составила 647.6 мкг/л, сапротрофных бактерий — 741.3 мкг/л. Наибольшие значения концентрации ИУК в культуральной жидкости были обнаружены у дрожжевых грибов Tausonia pullulans (штамм Y-6) - 3362,6 мкг/л, выделенного из гумусового почвенного горизонта варианта 1, и сапротрофных бактерий Flavobacterium рsychrophilum (штаммы: B-7 — 2616.8 мкг/л и B-5 — 1056.3 мкг/л, выделенных из гумусового почвенного горизонта варианта 1 и из торфа вариант 2. Для дрожжей Leucosporidium scottii и бактерий Flavobacterium рsychrophilum способность к синтезу ИУК показана впервые.
Ключевые слова: конструктоземгумусовый почвенный горизонт; почвенные конструкции; торф; ИУК; ауксин; дрожжи; сапротрофные бактерии; Сыктывкар; Москва
-
-
Разнообразие прокариотных сообществ сульфидных карстовых пещер чеченской республикиВестник Московского Университета. Серия 17. Почвоведение. 2026. № 3. c.65-75подробнее113
-
Впервые проведено комплексное изучение прокариотных сообществ (микробиомов) бактериальных матов и сноттитов карстовых пещер Шеки-Хьехи сравнение их с почвоподобными телами (ППТ) из пещеры Мухаммед-Хьехи расположенной рядом с пещерами бурой лесной почвой. Общая численность бактериальных клеток в матах и сноттитах варьировала в относительно узких пределах — от 0,26 до 0,35 млрд клеток∙мл‒1, быламаксимальной в плавучих бактериальных матах и минимальной — в сноттитах. В ППТ общая численность бактерий составляла 0,28 млрд клеток∙г‒1. Актиномицетный мицелий был обнаружен во всех образцах пещер, максимальные показатели обнаружены в плавучих бактериальных матах, минимальные — в бактериальных матах вдоль берега источника. Данные, полученные методом метабаркодинга (секвенирование гена 16S рРНК), свидетельствуют о высоком таксономическом разнообразии прокариотных сообществ исследованных субстратов. Максимальное разнообразие было обнаружено в плавучих бактериальных матах (25 филума, 74 рода). Во всех исследованных субстратах пещер доминировали филумы Pseudomonadota, Bacillota, в плавучих бактериальных матах также Bacteroidota. Ниже было содержание филумов Actinomycetota, Verrucomicrobiota, Chloroflexota, Chlorobiota и Thermodesulfobacteriota. Общими для почвы и плавучих бактериальных матов были 11 филумов бактерий — Pseudomonadota, Bacillota, Bacteroidota, Verrucomicrobiota, Chlorobiota, Chloroflexota, Actinomycetota,Acidobacteriota,Cyanobacteriota, Planctomycetota, Armatimonadotaи 2 филума-кандидата —Sumerlaeota и Hydrogenedentes. В образцах бактериальных матов обнаружено 2 филума домена Archaea— Woesearchaeota, Nanoarchaeota. В исследованных субстратах был детектирован 191 род домена Bacteria. Общими для бактериальных матов и почвы оказались лишь 12 родов — Brevundimonas, Devosia, Flavobacterium, Luteolibacter, Paenibacillus,Paenisporosarcina, Pseudarthrobacter, Pseudomonas, Rhodanobacter, Sphingomonas, Sumerlaea, Thermomonas. Специфической особенностью микробных сообществ плавучих бактериальных матов является высокая представленность родов бактерий, связанных с процессами трансформации соединений серы. Анализ функционального профиля микробных сообществ выявил преобладание в бактериальных матах функций, связанных с циклами серы и железа, в почве отмечено преобладание функций, связанных с циклом азота и хемогетеротрофии.
Ключевые слова: микробиота; почвоподобные тела; бактериальные маты; биопленки; сноттиты; метабаркодинг
-
-
Биологическая активность почв и сопряженных субстратов некоторых заповедников ВьетнамаВестник Московского Университета. Серия 17. Почвоведение. 2026. № 3. c.86-98подробнее103
-
Впервые комплексно изучена биологическая активность микробных сообществ в заповедных тропических экосистемах Вьетнама на четырех типах сопряженных субстратов: минеральная почва, растительный опад, ризосферная почва и «подвешенные» почвы в корзинах эпифитных папоротников (специфические почвоподобные образования).Показано, что «подвешенные» почвы и растительный опад характеризуются в 3–5 раз более высокой микробной биомассой (до 1,44 мг×г⁻<sup style="font-family: var(--ui-font-family-primary, var(--ui-font-family-helvetica));">1</sup>), а также значительно более интенсивными процессами эмиссии диоксида углерода, азотфиксации и денитрификации по сравнению с минеральными почвенными горизонтами. Выявленная высокая биологическая активность указанных субстратов соотносится с крайне высоким содержанием в них органического углерода (до 51,4%) и более низкими значениями pH. Впервые для данной территории количественно охарактеризована эмиссия метана, показавшая максимальные значения в верхнем слое почв (до 173 нг CH<sub style="font-family: var(--ui-font-family-primary, var(--ui-font-family-helvetica));">4</sub>×г⁻<sup style="font-family: var(--ui-font-family-primary, var(--ui-font-family-helvetica));">1</sup>×сут⁻<sup style="font-family: var(--ui-font-family-primary, var(--ui-font-family-helvetica));">1</sup>) и отрицательную корреляцию с высотой над уровнем моря (p=0,0001). Полученные данные позволяют идентифицировать растительный опад и эпифитные «подвешенные» почвы как ключевые локусы биогеохимических циклов азота и углерода в тропических лесах Вьетнама.
</p>Ключевые слова: азотфиксация; денитрификация; метаногенез; тропические леса; «подвешенные» почвы; эмиссия углерода
-
-
Численность и морфологическое разнообразие бактериофагов в городских почвах и твердых атмосферных выпадениях на территории г. МосквыВестник Московского Университета. Серия 17. Почвоведение. 2026. № 3. c.99-109подробнее99
-
В работе представлены результаты исследования численности и морфологического разнообразия бактериофагов в образцах городских почв (урбанозема и реплантозема) и твердых атмосферных выпадений (ТАВ), отобранных на территории Москвы на участках с контрастной антропогенной нагрузкой. Показано, что численность бактериофагов (вирусных частиц, ВЧ) в почвах (1,12–2,10109ВЧг‒1) выше, чем в ТАВ (0,42–0,64109ВЧг‒1), что коррелирует с общей численностью бактерий. Получена коллекция бактериофагов (колифагов), заражающих штаммы Escherichiacoli с различным составом клеточной поверхности (разными типами О-антигенов). Установлено, что выделенные в ходе работы колифаги относятся к классу Caudoviricetes(хвостатые фаги) и характеризуются сифовирусным (имеют длинный несократимый хвост) и подовирусным (имеют короткий хвост) типом морфологии. Полученные данные подчеркивают важную роль бактериофагов в функционировании микробных сообществ урбоэкосистем и их биотехнологическом потенциале для использования в биоремедиации городских почв.Ключевые слова: морфология фагов; антропогенная нагрузка; урбанозем; реплантозем; вирусные частицы (ВЧ); просвечивающая электронная микроскопия (ПЭМ); SYBR Gold
-


