Семиколенных Андрей Александрович

Впервые проведено комплексное изучение прокариотных сообществ (микробиомов) бактериальных матов и сноттитов карстовых пещер Шеки-Хьехи сравнение их с почвоподобными телами (ППТ) из пещеры Мухаммед-Хьехи расположенной рядом с пещерами бурой лесной почвой. Общая численность бактериальных клеток в матах и сноттитах варьировала в относительно узких пределах — от 0,26 до 0,35 млрд клеток∙мл^‒1, быламаксимальной в плавучих бактериальных матах и минимальной — в сноттитах. В ППТ общая численность бактерий составляла 0,28 млрд клеток∙г^‒1. Актиномицетный мицелий был обнаружен во всех образцах пещер, максимальные показатели обнаружены в плавучих бактериальных матах, минимальные — в бактериальных матах вдоль берега источника. Данные, полученные методом метабаркодинга (секвенирование гена 16S рРНК), свидетельствуют о высоком таксономическом разнообразии прокариотных сообществ исследованных субстратов. Максимальное разнообразие было обнаружено в плавучих бактериальных матах (25 филума, 74 рода). Во всех исследованных субстратах пещер доминировали филумы Pseudomonadota, Bacillota, в плавучих бактериальных матах также Bacteroidota. Ниже было содержание филумов Actinomycetota, Verrucomicrobiota, Chloroflexota, Chlorobiota и Thermodesulfobacteriota. Общими для почвы и плавучих бактериальных матов были 11 филумов бактерий — Pseudomonadota, Bacillota, Bacteroidota, Verrucomicrobiota, Chlorobiota, Chloroflexota, Actinomycetota,Acidobacteriota,Cyanobacteriota, Planctomycetota, Armatimonadotaи 2 филума-кандидата —Sumerlaeota и Hydrogenedentes. В образцах бактериальных матов обнаружено 2 филума домена Archaea— Woesearchaeota, Nanoarchaeota. В исследованных субстратах был детектирован 191 род домена Bacteria. Общими для бактериальных матов и почвы оказались лишь 12 родов — Brevundimonas, Devosia, Flavobacterium, Luteolibacter, Paenibacillus,Paenisporosarcina, Pseudarthrobacter, Pseudomonas, Rhodanobacter, Sphingomonas, Sumerlaea, Thermomonas. Специфической особенностью микробных сообществ плавучих бактериальных матов является высокая представленность родов бактерий, связанных с процессами трансформации соединений серы. Анализ функционального профиля микробных сообществ выявил преобладание в бактериальных матах функций, связанных с циклами серы и железа, в почве отмечено преобладание функций, связанных с циклом азота и хемогетеротрофии.